山东大学数据科学研究院于2018年7月成立，为学校直属独立建制的科研机构，研究院下设“大数据理论研究中心”“健康医疗大数据研究中心”“工程大数据研究中心”“计算社会科学研究中心”“山东系统与计算法学研究中心”。其中，健康医疗大数据研究中心同时挂牌“山东大学健康医疗大数据研究院”。
数据科学研究院按照高端性、交叉性、国际性的要求，聚焦国家重大需求，以数学为基础，围绕经济社会管理、工程技术、医疗卫生、法治等领域中的核心问题开展原创性、系统性、引领性的研究，力争建设成为具有世界影响力的数据集成平台、数据科学研发基地、数据价值创造与创新工场和数据人才培养高地。